Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Elk3P41971 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms