Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Tnfsf9P41274 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms