Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CskP41241 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CskP41241 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CskP41241 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CskP41241 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CskP41241 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CskP41241 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CskP41241 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CskP41241 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CskP41241 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CskP41241 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CskP41241 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CskP41241 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CskP41241 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CskP41241 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CskP41241 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CskP41241 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CskP41241 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CskP41241 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CskP41241 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CskP41241 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CskP41241 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CskP41241 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CskP41241 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms