Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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