Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfamP40630 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfamP40630 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfamP40630 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfamP40630 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TfamP40630 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TfamP40630 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms