Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps26aP40336 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms