Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ThpoP40226 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ThpoP40226 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ThpoP40226 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms