Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd1P40201 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd1P40201 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd1P40201 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chd1P40201 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd1P40201 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd1P40201 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd1P40201 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd1P40201 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd1P40201 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd1P40201 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms