Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprkP35822 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprkP35822 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprkP35822 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprkP35822 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprkP35822 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprkP35822 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprkP35822 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms