Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6fP35460 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms