Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms