Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms