Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd3P30282 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms