Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msr1P30204 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms