Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms