Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxrgP28705 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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