Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apex1P28352 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms