Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms