Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms