Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms