Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb3P28231 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms