Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms