Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjc1P28229 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms