Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CftrP26361 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CftrP26361 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CftrP26361 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CftrP26361 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CftrP26361 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CftrP26361 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CftrP26361 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CftrP26361 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CftrP26361 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CftrP26361 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CftrP26361 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CftrP26361 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CftrP26361 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CftrP26361 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CftrP26361 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CftrP26361 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CftrP26361 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CftrP26361 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CftrP26361 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CftrP26361 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CftrP26361 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CftrP26361 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CftrP26361 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CftrP26361 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CftrP26361 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CftrP26361 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CftrP26361 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CftrP26361 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CftrP26361 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CftrP26361 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CftrP26361 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CftrP26361 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CftrP26361 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CftrP26361 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CftrP26361 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CftrP26361 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CftrP26361 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CftrP26361 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CftrP26361 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CftrP26361 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CftrP26361 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CftrP26361 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CftrP26361 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CftrP26361 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CftrP26361 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CftrP26361 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CftrP26361 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CftrP26361 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CftrP26361 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CftrP26361 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CftrP26361 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CftrP26361 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CftrP26361 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CftrP26361 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CftrP26361 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CftrP26361 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CftrP26361 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms