Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms