Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RdxP26043 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RdxP26043 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RdxP26043 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RdxP26043 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RdxP26043 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RdxP26043 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RdxP26043 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RdxP26043 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RdxP26043 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RdxP26043 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RdxP26043 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RdxP26043 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RdxP26043 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RdxP26043 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RdxP26043 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RdxP26043 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RdxP26043 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RdxP26043 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RdxP26043 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RdxP26043 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RdxP26043 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RdxP26043 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RdxP26043 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RdxP26043 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RdxP26043 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RdxP26043 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RdxP26043 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RdxP26043 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RdxP26043 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RdxP26043 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RdxP26043 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RdxP26043 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RdxP26043 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RdxP26043 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RdxP26043 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms