Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UbtfP25976 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UbtfP25976 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UbtfP25976 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UbtfP25976 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UbtfP25976 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UbtfP25976 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UbtfP25976 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UbtfP25976 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms