Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LynP25911 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LynP25911 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LynP25911 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LynP25911 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LynP25911 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LynP25911 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LynP25911 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LynP25911 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LynP25911 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LynP25911 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LynP25911 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LynP25911 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LynP25911 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LynP25911 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LynP25911 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LynP25911 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LynP25911 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LynP25911 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LynP25911 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LynP25911 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LynP25911 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LynP25911 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LynP25911 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LynP25911 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LynP25911 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LynP25911 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LynP25911 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LynP25911 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LynP25911 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LynP25911 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LynP25911 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LynP25911 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LynP25911 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms