Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms