Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms