Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria2P23819 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria2P23819 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria2P23819 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria2P23819 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria2P23819 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria2P23819 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria2P23819 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria2P23819 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms