Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm29188-201ENSMUST00000191173 767 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm34099-201ENSMUST00000211592 704 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 D530037P16Rik-201ENSMUST00000199255 1027 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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