Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkchP23298 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkchP23298 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkchP23298 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkchP23298 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkchP23298 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms