Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RarbP22605 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RarbP22605 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RarbP22605 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RarbP22605 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RarbP22605 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RarbP22605 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RarbP22605 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RarbP22605 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RarbP22605 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RarbP22605 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RarbP22605 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RarbP22605 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RarbP22605 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RarbP22605 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RarbP22605 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RarbP22605 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RarbP22605 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RarbP22605 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RarbP22605 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RarbP22605 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RarbP22605 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RarbP22605 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms