Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms