Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ntf3P20181 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms