Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VimP20152 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VimP20152 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VimP20152 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VimP20152 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms