Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifrd1P19182 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms