Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms