Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka1P18653 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms