Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcna1P16388 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcna1P16388 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcna1P16388 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcna1P16388 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcna1P16388 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcna1P16388 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcna1P16388 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcna1P16388 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcna1P16388 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcna1P16388 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcna1P16388 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcna1P16388 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms