Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp53P15975 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms