Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptbP15508 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SptbP15508 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SptbP15508 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SptbP15508 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SptbP15508 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SptbP15508 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SptbP15508 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SptbP15508 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SptbP15508 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SptbP15508 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SptbP15508 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SptbP15508 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SptbP15508 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms