Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrphP15331 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrphP15331 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrphP15331 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrphP15331 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrphP15331 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrphP15331 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrphP15331 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrphP15331 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrphP15331 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrphP15331 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrphP15331 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrphP15331 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrphP15331 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrphP15331 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrphP15331 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrphP15331 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrphP15331 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrphP15331 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrphP15331 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PrphP15331 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrphP15331 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrphP15331 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrphP15331 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrphP15331 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrphP15331 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrphP15331 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrphP15331 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrphP15331 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrphP15331 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrphP15331 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrphP15331 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrphP15331 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrphP15331 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrphP15331 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrphP15331 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrphP15331 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrphP15331 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrphP15331 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms