Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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