Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms