Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms