Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ApcsP12246 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms