Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt8P11679 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms