Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms